Массовая активация свойства «Показывать в умном фильтре» для всех свойств инфоблока

Достаточно в командной строке в админке (Настройки → Инструменты → Командная PHP-строка) выполнить следующий код:

<?php

CModule::IncludeModule('iblock');

$propsList = CIBlockProperty::GetList([], ['IBLOCK_ID' => IBLOCK_ID]); // ID инфоблока

while ($property = $propsList->Fetch()) {
    CIBlockProperty::Update($property['ID'], [
        'IBLOCK_ID' => $property['IBLOCK_ID'],
        'SMART_FILTER' => 'Y',
    ]);
}